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Oleafly/Oleafly
GitHub用于学术研究的引用管理，支持在OpenAlex、PubMed等数据库搜索论文，提取元数据，验证引用准确性，并生成BibTeX或Hayagriva YAML格式条目。
Install All Skills
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Skills in Collection (38)
用于学术研究的引用管理，支持在OpenAlex、PubMed等数据库搜索论文，提取元数据，验证引用准确性，并生成BibTeX或Hayagriva YAML格式条目。
搜索学术论文
转换DOI为BibTeX
验证引用信息
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill citation-management -g -y
驱动用户授权桌面应用和网站的自动化操作，涵盖点击、输入及网页浏览等交互。适用于无法通过专用连接器处理的特定软件任务，如文献导出或表单填写。
需要在桌面软件（如Excel、Zotero）中执行操作
需要在受信任网站进行浏览或提交
其他工具无法完成的界面交互任务
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Computer Use -g -y
对受信任的本地科学数据文件（如CSV、JSON、HDF5等）进行受限的探索性数据分析，包括缺失值审计、异常值检测及报告生成，严禁执行代码或处理外部资源。
需要分析本地结构化数据文件的分布和完整性
在建模前进行数据质量检查和探索性统计
检查非标准格式文件（如HDF5、FASTA）的元数据
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill exploratory-data-analysis -g -y
将观察转化为透明、可检验的研究计划，生成候选假设、对立解释及预注册分析方案。强调区分概念边界与证据，严禁将假设视为事实或提供临床/危险操作建议，确保研究伦理与安全合规。
需要基于初步发现制定科学研究计划
要求生成可证伪的假设和预测
需要构建预注册分析方案
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill hypothesis-generation -g -y
清理从Word、Markdown或PDF导入的文档，修复pandoc残留和编译错误，确保项目结构清晰且可正常编译。
文档导入后存在格式残留
文档编译失败或包含错误
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Import refine -g -y
用于执行系统性文献综述，涵盖多数据库搜索、结果综合及引用验证。自动生成符合学术规范的Markdown和PDF文档，并强制要求生成科学示意图以增强可视化效果。
进行系统性文献综述
撰写研究论文或论文的文献综述部分
执行荟萃分析或范围综述
需要经过验证的引用和专业格式输出
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill literature-review -g -y
oleafly CLI 用于构建、诊断和检查 LaTeX/Typst/Markdown 项目。支持编译修复、结构分析、统计导出及引用管理，辅助 AI Agent 自动化处理文档构建与调试任务。
修复文档编译错误
检查项目结构与依赖
获取文档统计或导出格式
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-cli -g -y
负责将项目数据转化为手稿中的统计结果，通过加载专业分析技能并执行脚本，确保输出可复现、符合APA规范，严禁直接操作原始数据。
需要生成包含统计数据的手稿章节
处理数据文件以提取数值和图表
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Data analysis -g -y
用于在Oleafly研究任务中执行迭代实验，通过基线对比、单变量变更和自动记录来优化指标或复现结果。
需要改进特定业务指标
模型调优或分析方法比较
需要复现实验结果
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-experiment-loop -g -y
用于在Oleafly手稿中构建和插入出版级图表，支持TikZ、pgfplots、CeTZ、matplotlib等工具，涵盖数据可视化、架构图及科学插图。
需要生成数据图表
需要绘制架构图或流程图
需要处理科学插图
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Figure prep -g -y
自动化文档构建与错误修复，支持 LaTeX、Typst 等引擎。通过读取日志、分类错误并执行最小化编辑，循环调试直至编译成功，解决包缺失、引用错误及格式问题。
编译失败或报错
请求修复构建差异
处理未定义控制序列或字体加载失败
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Build and fix -g -y
在Oleafly项目中为各类学术论文、会议投稿或期刊文章构建符合特定格式要求的LaTeX骨架，支持多引擎编译及现有内容扩展。
用户希望开始撰写论文并设置特定期刊或会议的模板结构
用户请求生成main.tex文件、章节结构或参考文献配置
用户要求将现有草稿调整为特定期刊的排版格式
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Manuscript scaffold -g -y
用于在上传 arXiv 或期刊前进行预检，检查匿名性、页数限制、参考文献、编译错误及源文件规范，输出通过/失败清单。
准备 arXiv 提交
准备会议或期刊投稿
检查双盲评审匿名性
验证参考文献和格式规范
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-pre-submission -g -y
学术论文研究项目路由器，负责初始化文件布局、规划多阶段工作流（文献综述、草稿、审稿等），并指引加载对应子技能以完成论文写作全流程。
撰写论文
开始文献综述
准备投稿材料
回复审稿意见
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-research-loop -g -y
将审稿人意见与论文修改内容映射，生成逐点回复信。支持LaTeX/Typst排版及纯文本格式，用于期刊或会议 rebuttal。
准备学术回复信
整理审稿意见与修改对应关系
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-response-letter -g -y
用于对学术论文、预印本或论文草稿进行同行评审。该技能严格禁止修改原文，通过读取源码、编译PDF及加载检查清单，分析论证、方法统计和引用问题，最终生成包含优缺点、详细注释和评分的结构化评审报告。
需要审查学术论文或草稿
请求对研究稿件进行同行评审
评估论文的方法论或统计数据
生成结构化的学术评审报告
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-review-manuscript -g -y
将论文转化为演讲幻灯片或会议海报，支持 Beamer、Typst 及 LaTeX 格式。自动解析论文结构生成大纲，根据时长调整内容，并处理编译与预览流程。
需要制作学术演示文稿
请求生成会议海报
要求将论文转为 PPT 或 Beamer 格式
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-slides-and-posters -g -y
逐条审计章节声明与引用来源的一致性，识别未支持或夸大陈述。通过提取事实、映射引用键并收集证据，生成支持度报告及修复建议，确保内容真实可靠，不直接修改原文。
检查引用准确性
验证章节声明
查找无支持的陈述
确认无伪造内容
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-verify-claims -g -y
通过 orx CLI 管理 OpenResearch 实验、文献搜索及结果记录。支持检查环境、引导安装、执行命令及查询项目/运行/日志状态，辅助科研写作与实验追踪。
用户提及 orx 或 OpenResearch
需要启动、轮询实验或撰写实验报告
涉及实验树、run id 或文献搜索
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill OpenResearch (orx) -g -y
在PDF导入后，逐节重建可编辑的LaTeX项目。重构章节、公式、表格和参考文献，严格对照原文验证，确保无虚构内容，并维护进度日志以支持跨会话恢复。
用户需要将PDF转换为可编辑的LaTeX源码
PDF导入器已完成初步提取但结构缺失
需要修复或完善LaTeX文档的结构与内容
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill PDF to LaTeX -g -y
辅助人类对科学手稿、协议或研究提案进行严格、可操作的同行评审。提供结构化评估模板，执行证据-声明核查，涵盖方法、统计、伦理及引用批评，并生成修订响应计划。
准备科学论文或预印本的同行评审草稿
检查研究主张与证据的一致性
评估方法、统计或可重复性
规划修改回复策略
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根据本地JSON清单生成可编辑的科学海报PPTX，严格校验内容、资产与打印规范。
需要生成科研或会议海报
要求对PPTX进行物理尺寸、可访问性及包安全审计
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用于撰写NSF、NIH等机构竞争性科研基金申请书，涵盖特定格式、预算、影响力声明及合规性要求。
撰写科研基金提案
准备项目描述或技术叙事
制定预算说明和人员分配计划
回复评审意见
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用于为科学手稿或研究简报编译外部学术证据。支持文献调研、参考收集及结构化证据矩阵生成，默认采用并行搜索策略以确保引用质量与数量。
需要为科学手稿整理背景文献
请求高质量学术参考文献
需要验证科学主张的证据
要求生成结构化证据矩阵
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提供基于证据的学术作品发展性反馈，审计低风险评估流程。严禁用于人员排名或高影响决策，遵循负责任评估原则。
学术论文或研究想法的发展性评审
评估流程的质量与合规性审计
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scholar-evaluation -g -y
辅助科学领域的早期研究头脑风暴，通过结构化讨论、假设透明化和对抗性审查来生成和评估研究方向提案。严格区分创意与验证，确保伦理合规，并引导至后续专业环节。
需要生成科学研究方向或假设
对候选研究思路进行优先级排序
进行证据意识的科学构思
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用于评估科学主张与证据质量，涵盖实验设计、偏见识别及GRADE/Cochrane框架应用。辅助科研方法批判、统计有效性分析及逻辑谬误识别，旨在提升对研究严谨性的理解与缺陷发现能力。
评估研究方法和实验设计
识别研究中的偏见和混杂因素
应用GRADE或Cochrane风险评估框架
审查科学主张和结论的合理性
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用于构建科研演讲幻灯片，支持会议、答辩等场景。提供结构规划、视觉设计及LaTeX/PowerPoint生成指导，强调图文并茂与故事性叙事。
准备会议报告或学术讲座
制作论文答辩或基金申请演示文稿
需要自动生成科学主题幻灯片
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scientific-slides -g -y
用于使用Matplotlib等库创建符合出版标准、可访问且真实的科学图表。涵盖多面板布局设计、不确定性展示、色彩对比审查及元数据验证，确保数据完整性与期刊合规性。
需要生成用于论文或报告的科学图表
检查现有图表的可访问性与数据真实性
处理缺失数据或不确定性的可视化
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scientific-visualization -g -y
辅助起草、修订和审计科学手稿，确保证据溯源、报告规范合规及数据保密。严禁捏造引用或数据，强制人工验证事实，区分撰写与审核阶段，保障科学准确性与可追溯性。
起草科学论文或报告
审计稿件证据链与规范性
处理敏感科研数据保密审查
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scientific-writing -g -y
将当前文档转换为可复用的Oleafly模板，遵循打包规则。通过读取规范、分离结构与占位符、生成通用内容，确保模板独立编译且无特定论文数据。
make this a template
save this layout
reuse this format for future papers
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用于准备期刊、会议论文及基金申请书，提供基于最新官方规则的验证流程、LaTeX模板脚手架及写作指南。
查找期刊或会议作者指南
检查页数限制和匿名规则
选择并适配LaTeX模板
准备NSF/NIH等基金提案
设计研究海报
检查PDF页面数和字体
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill venue-templates -g -y
用于在数据收集前设计实验方案，包括选择设计类型、随机化、区组划分及处理组合布局，以消除混杂因素并提升结果可解释性。适用于试验规划与分组策略制定。
如何分配受试者到不同组别
避免混淆变量或伪重复
设计多因子实验（DOE）
确定样本量前的实验结构
设置区组或分层随机化
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill experimental-design -g -y
将研究问题转化为带出处的注释阅读列表。通过多库搜索、读取论文、验证引用并去重，生成结构化文献综述和 BibTeX，避免无效标题堆砌。
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进行文献调研
收集某主题背景资料
为章节补充来源
完善参考文献列表
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-literature-sweep -g -y
提供11个学术文献API的检索能力，支持论文查找、DOI/PMID解析、全文获取及引用分析。强调通过验证响应结构而非仅状态码来确保结果准确性，并记录完整溯源信息以保障可重复性。
查询特定论文或作者出版物
查找某主题的学术论文
获取论文全文或PDF
解析DOI/PMID/arXiv ID
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill paper-lookup -g -y
提供研究数据的统计分析指导，涵盖假设检验、回归、相关及贝叶斯分析。支持假设验证、效应量计算、功效分析及APA格式报告，确保分析的严谨性与可复现性。
需要进行t检验、ANOVA或卡方检验等假设检验
执行回归或相关性分析
运行贝叶斯统计分析
检查统计假设与诊断
计算效应量或进行功效分析
撰写符合APA格式的结果报告
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill statistical-analysis -g -y
用于研究规划中的样本量和统计功效计算，支持先验分析、最小可检测效应及各类实验设计的公式或模拟计算。
询问需要多少受试者/样本/重复次数
进行先验功效分析或计算最小可检测效应
为基金申请或伦理审查提供样本量依据
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill statistical-power -g -y
