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ResearAI/DeepScientist
GitHub指导AI在Windows环境下通过WSL2安装、修复并验证DeepScientist，包括环境检查、依赖配置及Web UI连通性测试。
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Skills in Collection (22)
指导AI在Windows环境下通过WSL2安装、修复并验证DeepScientist，包括环境检查、依赖配置及Web UI连通性测试。
需要在Windows上使用WSL2部署DeepScientist
DeepScientist安装失败或需要修复环境
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通过alphaxiv.org API查询arxiv论文，获取结构化AI摘要或全文。适用于解析URL/ID、提取报告及处理404异常，辅助快速理解学术内容。
用户分享arxiv或alphaxiv链接
用户提供论文ID
用户请求解释、总结或分析研究论文
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用于在主实验后执行消融、鲁棒性、错误分析等后续验证任务。旨在以最小资源回答关键证据问题，支持论文写作或决策，强调资源约束与结果隔离。
主实验结果已存在且需补充证据
需要进行消融实验或鲁棒性检查
应对审稿意见或发现证据缺口
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用于确立可信基准线及其指标，支持附件导入、本地验证、修复失败复现或发布基准。通过最小化证据收集与明确对比契约，确认、豁免或阻断基准，防止无效重复工作。
需要建立或导入可信基准线
现有基准线过时或未经验证
复现失败需修复
验证本地代码或服务作为对比基准
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用于在任务进展不明确、证据混杂或需重大决策时，基于确凿证据进行路由判断（如继续、停止、分支等），记录理由并推动流程。
下一步不明显
证据矛盾
需要停止或分支
用户偏好选择
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用于在基线确认、方案选定后，执行核心实验以产出可信测量结果。强调最小化执行成本，规范假设定义与代码变更映射，确保证据有效性并记录结论。
基线已接受且想法已选定
评估契约明确需执行实施与测量
进入具体实现阶段而非框架设计
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用于对重要学术图表进行美化与标准化，确保视觉清晰、风格克制。适用于论文主图、附录图及里程碑报告等持久化图像的最终润色。
需要生成论文级高质量图表
对已有实验图表进行最终样式审查与优化
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用于负责任地关闭或暂停任务，确保留下稳定的停止点和清晰的恢复路径。通过更新计划、清单和状态报告来协调最终结论、限制及推荐，避免重复工作。
任务准备结束或归档
需要生成最终总结和路线图
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将基线与问题转化为可测试的研究方向，通过明确目标、分析现状与矛盾、文献调研，筛选出2-3个高价值候选方案并推荐下一步执行路线。
已有基线但下一步研究路线未定
当前路径失败需要新的可证伪方向
需决定尝试何种机制或解决瓶颈
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用于任务非从零开始时，审计、信任排序并整合现有基线、结果或草稿，以恢复可信起点。明确下一步执行锚点，避免重复重建状态。
任务已有部分完成状态需继续
存在需要整合的旧数据或草稿
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用于将学术手稿润色为《自然》风格的英语，支持段落重构、翻译及出版级语言优化。遵循论文架构与写作策略，确保逻辑严谨与表达地道，适用于摘要、引言等全章节的学术写作提升。
用户要求润色学术论文段落或全文
需要将中文学术草稿翻译并优化为高质量英文
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用于算法优先场景的优化技能，管理候选简报、前沿状态及分支推广，通过探索、利用或融合等子模式推进有依据的优化步骤。
需要管理多个优化候选方向并排序
已有持久化优化线需进行探索或利用
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在撰写学术论文前，将实验证据转化为清晰的大纲。区分读者视角与证据细节，提炼核心观点、主张及分析计划，剔除工程噪音，确保大纲具备学术价值与逻辑严谨性。
创建或修订研究论文大纲
验证论文大纲结构
修复过于技术化的论文草稿
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将结构化数值数据转换为出版级图表，基于预置模板快速生成柱状、折线等高质量图片。适用于实验结果可视化及论文写作场景。
用户需要提供结构化数据并生成高质量图表
需要将测量值或CSV数据转为发表论文级别的插图
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用于论文或项目评审阶段的回复技能，将审稿人反馈转化为最小化的诚实修订计划。包括解析评论、分类需求、协调实验与文本修改，并组装最终回复文档和修订账本。
收到审稿人或审查者的反馈意见
需要针对现有草案或评审包进行正式回复
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用于对实质性草稿或论文进行独立、批判性且基于证据的审计，旨在减少修订歧义。通过识别核心主张、评估新颖性与严谨性，输出具体修订计划和后续实验清单，并指导下一步决策。
需要对已完成的论文或报告草案进行预发表审查
需要独立专家视角的批判性反馈以改进内容
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用于自然科学与工程任务，指导选择科学软件包并记录证据图。通过 bash_exec 执行模拟、数据分析及 HPC 工作流，支持模型拟合与结果验证。
需要进行自然科学或工程领域的仿真计算
涉及科学软件包的检查与环境验证
需要分析科学数据集或进行模型拟合
执行高性能计算（HPC）任务
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用于在任务模糊、指标或基线未明确时，通过最小化探索重构研究框架，明确评估契约和基线方向，为后续执行提供清晰锚点。
用户目标模糊不清
数据集或评估指标不明确
缺乏可信基线
文献或仓库背景薄弱
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用于在已有实验结果和基线时，撰写、修订或优化论文/报告。强调先制定基于证据的修订策略，确保声明有据可依，再按章节起草内容，避免无依据的写作。
起草论文或报告
修订现有草稿
同步声明与证据支持
准备论文提交包
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辅助作者准备符合Nature期刊要求的数据可用性声明、数据存储库计划、数据集引用及FAIR元数据清单，支持中英对照与受限数据处理。
询问Nature数据可用性政策
需要生成数据可用性声明
选择数据存储库或获取 accession number
处理受限数据或敏感数据的共享说明
中文用户进行数据可用性相关的中英翻译
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面向Nature等高水平期刊的科研绘图工作流，支持Python和R后端。用于生成、修订及审核符合投稿标准的多面板科学图表，强调视觉论证逻辑与导出规范。
创建或修改符合期刊要求的科学图表
对多面板科学图进行审计或润色
需要生成SVG/PDF/TIFF等出版级输出
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将科学论文转换为符合Nature风格的中文PPTX演示文稿。适用于组会、论文分享等场景，自动提取核心论点与图表，生成完整幻灯片及讲稿。
制作学术报告PPT
生成期刊俱乐部幻灯片
从论文创建演示文稿
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