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Oleafly/Oleafly
GitHub用于学术研究的引用管理，支持搜索论文、提取元数据、验证引用并生成BibTeX或Hayagriva格式。
Install All Skills
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Skills in Collection (38)
用于学术研究的引用管理，支持搜索论文、提取元数据、验证引用并生成BibTeX或Hayagriva格式。
搜索学术论文
转换DOI为BibTeX
验证引用准确性
生成参考文献列表
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill citation-management -g -y
控制用户授权的桌面应用和网站，通过点击、输入等操作执行特定任务。适用于无法通过专用连接器完成的工作，如文献导出或表格填写。需遵循会话流程并遵守安全限制。
需要在桌面应用中操作数据
需要访问受控网站执行交互
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Computer Use -g -y
对本地受支持的科学数据文件（如CSV、JSON、HDF5等）进行受限的探索性数据分析，包括缺失值审计、异常值检测和报告生成，确保操作安全且仅限只读。
需要分析结构化或科学数据文件的分布和完整性
在进行建模前对数据进行初步探索和审计
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill exploratory-data-analysis -g -y
将观察转化为透明、可检验的研究计划，生成假设、预测及分析方案。严格区分概念，遵守伦理与数据隐私边界，避免因果谬误或不当建议。
需要基于初步发现制定科学研究计划
要求生成可证伪的假设和竞争解释
设计预注册分析方案以验证因果关系
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill hypothesis-generation -g -y
用于清理从Word、Markdown或PDF导入的文档项目，修复Pandoc残留代码和编译错误，优化排版使其符合规范。
导入文档后存在编译错误
文档包含Pandoc遗留标记
需要标准化文档导言区
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Import refine -g -y
用于执行系统性的文献综述、元分析及研究综合。支持多数据库搜索、引用验证及专业文档生成，强制结合科学图表技能以增强可视化效果，适用于学术研究场景。
进行系统性文献综述
撰写研究论文或学位论文的文献综述部分
执行元分析或范围综述
识别研究领域中的研究空白和未来方向
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill literature-review -g -y
oleafly-cli 用于在终端或 AI Agent 中构建、诊断和检查 Oleafly LaTeX/Typst/Markdown 项目。支持编译错误修复、结构分析、字数统计、格式导出及引用管理，旨在自动化文档处理流程。
用户要求修复无法编译的文档
需要获取项目结构如文件列表、大纲、引用状态
执行文档字数统计或导出为 Word/HTML 等格式
进行参考文献查找或清理
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-cli -g -y
负责项目数据分析全流程，包括环境检查、统计方法选择及脚本执行。确保数据只读、分析可复现，并将结果以APA格式输出至指定目录，连接原始数据与论文结果。
需要处理项目中的数据文件并生成分析结果
需要将统计数据转化为论文中的数字、图表和表格
需要执行统计检验或效应量计算
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Data analysis -g -y
用于在Oleafly研究任务中运行实验循环，通过基线对比、单变量变更和严格记录，验证假设是否提升指标。支持自动化执行、结果追踪与报告生成。
需要改进指标或调优模型
比较不同方法效果
复现特定实验结果
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-experiment-loop -g -y
用于在Oleafly手稿中构建和插入出版级图表，支持TikZ、pgfplots、CeTZ、matplotlib等多种工具，涵盖数据可视化、架构图及科学示意图的生成与排版。
用户需要生成或编辑学术/出版级图表
请求使用TikZ、pgfplots、CeTZ、fletcher、matplotlib或seaborn绘制图形
需要处理图表尺寸、配色方案、图注、标签或交叉引用
需要将CSV数据转换为图表或多面板组合图
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Figure prep -g -y
驱动文档编译、诊断并修复错误，直至构建成功。适用于 LaTeX、Typst 等引擎的编译失败、日志分析及最小化代码修复。
编译失败
出现未定义控制序列或文件未找到错误
用户询问为何构建结果不同
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Build and fix -g -y
为学术写作项目构建符合特定期刊或会议格式要求的 LaTeX/Typst 骨架。自动识别目标 venue，加载对应模板并生成编译就绪的结构化文件，支持论文、期刊及预印本等场景。
用户希望启动论文写作或设置投稿格式
请求生成 main.tex 及章节结构
要求将现有草稿调整为特定 venue 布局
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Manuscript scaffold -g -y
用于在提交至arXiv或会议前执行预检，检查编译错误、引用完整性、匿名性、页数限制及源文件规范，生成通过/失败清单。
准备论文提交至arXiv或期刊
检查双盲评审匿名性
验证页数和参考文献格式
构建干净的上传源包
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-pre-submission -g -y
学术研究全流程编排技能，负责初始化项目结构、读取现有笔记与文献索引，并通过待办事项规划论文写作、文献综述、图表准备及投稿检查等阶段，确保研究工作的有序进行。
用户表示正在撰写论文
开始文献综述
起草相关工作部分
检查引用
准备图表
回复审稿人意见
准备提交稿件
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-research-loop -g -y
将审稿人意见与论文修改内容映射，生成逐点回复信（LaTeX/Typst及纯文本），用于学术投稿 rebuttal。
需要撰写学术论文的审稿人回复信
准备期刊或会议的 rebuttal 材料
将审稿意见与代码/文档变更进行对照
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-response-letter -g -y
对学术论文、预印本或论文草稿进行同行评审，生成结构化报告。涵盖支持性声明、方法统计、图表引用等问题的识别，提供优势、主要/次要意见及评分，严禁修改原稿文件。
需要审查学术论文
请求对稿件进行裁判式评估
发现未受支持的声明或统计问题
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-review-manuscript -g -y
将论文转换为幻灯片或会议海报，支持Beamer、Typst等格式。通过提取大纲并构建文件，适配不同时长和受众需求。
需要制作演示文稿
请求生成会议海报
要求将论文转为幻灯片
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逐条审计章节声明与引用源的对应关系，识别未支持或夸大陈述，生成支持度报告。不修改原文，仅输出分析结果，确保学术严谨性。
验证引用准确性
检查声明是否被来源支持
查找无依据陈述
准备稿件审查
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-verify-claims -g -y
通过本地 orx CLI 管理 OpenResearch 实验项目、文献搜索及运行记录，支持检查环境、安装指引及执行各类查询与状态监控命令。
用户提及 orx 或 OpenResearch
需要启动、轮询实验或撰写实验报告
涉及实验树、run id 或文献检索
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill OpenResearch (orx) -g -y
在PDF导入器初步处理后，人工重建可编辑的LaTeX项目。按章节重构标题、数学公式、表格和引用，严格依据原文验证，确保内容准确无误且支持跨会话恢复。
用户要求修复或完善已导入的PDF转LaTeX文档
需要恢复因中断而暂停的LaTeX重建任务
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill PDF to LaTeX -g -y
辅助人类对科学手稿、协议或研究提案进行严谨、建设性的同行评审。提供结构化评估模板，执行声明与证据核查、方法统计及伦理审查，并严格遵循保密与安全边界，生成可操作的修订建议草案。
准备科学论文或预印本的同行评审草稿
检查研究主张与证据的一致性
评估实验方法、统计分析及可重复性
规划针对审稿意见的回复策略
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill peer-review -g -y
基于本地JSON生成可编辑的科研海报PPTX文件，严格校验内容、尺寸及资产安全。禁止外部请求或宏，确保符合打印与学术规范，实现自动化且安全的文档构建流程。
需要生成符合特定打印要求的PowerPoint研究海报
要求从受控本地资产和精确元数据构建可编辑PPTX
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协助撰写NSF、NIH等机构的竞争性研究资助提案，涵盖特定格式、预算编制、影响力陈述及合规性审查。
撰写科研基金申请书
准备项目描述或技术叙事
制定预算说明和里程碑计划
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为科学手稿或研究简报编译当前学术证据，默认目标60条验证过的独特参考文献。用于收集文献、背景证据、竞争发现或结构化证据矩阵，支持并行搜索与提取，产出就绪的研究数据包。
用户明确要求收集手稿所需的文献和背景研究
需要大量高质量学术参考文献以支持科学主张
要求生成结构化证据矩阵或声明到来源的映射
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提供基于证据的学术作品发展性反馈，审计低利害评估量表的公正性与可追溯性。严禁用于人员排名或高风险决策，聚焦研究质量评估与流程合规审查。
请求对论文、草案或研究想法进行定性反馈
要求审计评估量表的公平性、隐私或治理结构
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辅助科学创意发散，结构化生成研究假设并透明评估优先级。适用于早期研究构思、方向筛选及候选方案辩论，强调独立生成、证据审查与伦理边界，不替代实证验证或临床决策。
需要生成科学研究假设或实验概念
对多个研究方向进行优先级排序和评估
早期阶段的研究头脑风暴
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scientific-brainstorming -g -y
评估科学主张与证据质量，分析实验设计有效性、识别偏见及混杂因素，应用GRADE等框架进行批判性分析。
评估研究方法论和实验设计
审查科学主张和结论
识别研究中的偏见和混杂因素
应用GRADE或Cochrane风险评估
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专为科研演讲设计的演示文稿生成技能，支持PowerPoint和LaTeX Beamer。提供结构化规划、视觉设计模板及时间指导，强调通过高质量图表和故事线提升展示效果，适用于会议、答辩等场景。
准备学术研讨会或会议演讲
制作论文答辩幻灯片
生成研究主题的演示文稿
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用于创建和审计符合出版标准的科学图表，涵盖Matplotlib等工具使用、数据真实性校验、无障碍设计及期刊规范核查。
需要生成科研论文插图
检查图表是否存在误导性编码
验证图表的无障碍合规性
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辅助起草、修订和审计科学手稿，确保证据溯源、报告规范覆盖及保密合规。严禁捏造数据或引用，强调人工验证与不确定性披露，适用于论文撰写、投稿准备及学术内容审核场景。
起草科学手稿章节
修订学术论文
审计参考文献与声明
检查数据一致性
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill scientific-writing -g -y
将当前文档转换为可复用的Oleafly模板，遵循作者规范。包括读取规则、拆分结构与占位符、替换真实内容为虚构填充物，并编译检查，最终指导用户手动安装至画廊。
make this a template
save this layout
reuse this format for future papers
build a starter for my group
add a template to the New Project gallery
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill Reusable template -g -y
用于准备期刊论文、会议论文、研究海报及资助申请书。通过验证最新场地规范，利用捆绑的LaTeX模板和写作指南，确保文档格式合规并符合审稿人期望。
准备学术投稿或基金申请文档
查询特定期刊或会议的排版规则与页数限制
适配LaTeX模板以符合官方要求
检查提交PDF的页面计数和字体
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill venue-templates -g -y
用于在数据收集前设计实验方案，包括选择设计类型、随机化、区组划分及处理组合布局，确保结果可解释。适用于研究规划、因子筛选、响应面优化等场景。
如何设置实验以避免混杂因素
分配样本到不同组别
提及随机化、区组或分层
设计多因子实验或筛选设计
确定样本量或功效前的设计阶段
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill experimental-design -g -y
将研究问题转化为带来源证明的注释阅读列表。通过并行搜索多个学术数据库，读取核心论文并验证引用信息，去重后生成标准化的阅读清单及 BibTeX 条目，确保文献检索的准确性和可复现性。
查找相关学术论文
进行文献综述
收集特定主题的背景资料
整理参考文献列表
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill oleafly-literature-sweep -g -y
提供11个学术文献API的检索能力，支持论文查找、DOI/PMID解析、全文获取及引用分析。强调结果可复现性，需根据意图选择权威数据库，验证响应结构以避免静默错误，并遵循速率限制和分页规范返回带溯源信息的结果。
查询特定论文或摘要
通过DOI/PMID/arXiv ID查找文献
搜索某主题或作者的论文
获取开放获取全文或PDF
分析引用关系图谱
npx skills add Oleafly/Oleafly --skill paper-lookup -g -y
提供研究数据的系统化统计分析技能，涵盖假设检验、回归、贝叶斯分析、假设检查及APA格式报告。适用于比较组别、验证假设、计算效应量和样本量等科研数据分析场景。
需要进行统计假设检验（如t检验、ANOVA）
执行回归或相关性分析
进行贝叶斯统计分析
检查统计假设和诊断
计算效应量和功效分析
以APA格式撰写统计结果
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用于研究设计前的样本量和统计功效计算，涵盖t检验、回归等封闭公式及模拟方法，帮助确定所需样本量、最小可检测效应或生成功效曲线。
询问需要多少样本/受试者
进行先验功效分析
计算最小可检测效应(MDE)
为资助或协议提供样本量依据
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